La distillerie fut fondée en 1823, dans les bâtiments d'une brasserie créée en 1798 par le même John Sinclair. La distillerie Tobermory est la seule distillerie légale sur l'ile de Mull. Elle portait à l'époque le nom de Ledaig. La distillerie connut une première période de fermeture entre 1837 et 1878. La distillerie fut vendue en 1890 à John Hopkins & Co qui l'intégra à la D.C.L. (Distillers Company Ltd.) en 1916. Fermée à nouveau en 1928 pendant plus de 40 ans, Tobermory rouvrit en 1972 sous le nom de Ledaig. L'une des sociétés qui contribua à sa réouverture n'était autre que le producteur de xérès Domecq. Cependant, dès 1975, la distillerie fut de nouveau mise en sommeil. Il fallut attendre 1990 pour qu'elle reprenne son activité sous le nom Tobermory. La distillerie produit deux single malts, l'un non tourbé, Tobermory, et l'autre extrêmement tourbé, Ledaig. La plus grande partie de la production est utilisée pour les assemblages du groupe Scottish Leader et Black Prince et 50% sont vendus à d'autres assembleurs. La distilerie appartient à la société Ecossaise Burn Stewart (propriétaire également de Bunnahabhain et Deanston .